一、苹果虎皮病
苹果虎皮病是某些品种苹果在低温贮藏的中后期发生的一种最严重的生理性病害。虎皮病的典型症状是在果实表面出现褐色至深褐色的不规则凹陷病斑，形如烫伤，故又称褐烫病。发病初期，果面（尤其果实阴面）出现不规则的褐色斑块，病斑较小，皮下果肉组织正常。随着病情的加重，病斑扩展连结成片，以至整个果面甚至皮下果肉都发生褐变，发病部位会出现凹陷和皱缩症状。发病果实的外观品质受到严重影响，商品价值降低，而且果实极易感染病菌而腐烂，常常造成巨大的经济损失。
一般认为，α-法尼烯的氧化产物与虎皮病发生有关。抑制α-法尼烯的产生和氧化过程的措施可以控制虎皮病的发生，但虎皮病发生致病机理至今仍不清楚，有关虎皮病发生的分子基础正在研究中。
影响虎皮病发生因素的很多，可概括为品种敏感性、采前因素和采后因素三个方面。对虎皮病的敏感程度从大到小依次为国光、倭锦、金冠、红星、红香蕉、青香蕉、鸡冠、富士、印度等；成熟度与虎皮病的发生密切相关，未成熟果实含有的抗氧化物质低比成熟果实更易发病，采前清天凉爽、潮湿的天气会减少发病，而后期干热天气则会增加其感病敏感性。栽培期内氮肥施用过多会增加虎皮病的发生率，含钙量低比含量高的苹果更易发病；苹果采后及时入库、降低湿度可减少虎皮病的发生。更多的研究表明，02和CO2浓度的适当组合可以很好地保持果实品质，延缓虎皮病的发生。去除乙烯不但可延缓果实的衰老，还可减轻虎皮病的发生。1-MCP在抑制乙烯的产生的同时，也显著降低了虎皮病的发生率。由于影响因素众多，不同年份、产地和采收期的果实虎皮病发生情况存在较大差异。
过去生产上一般采用化学药物二苯胺、乙氧基喹来控制虎皮病发生，但近年来这两种药物在许多国家已被禁用，消费者越来越不接受化学药剂处理的水果。目前虎皮病的防治在果实采收前注意采收期，做到适时采收，分期采收，提高采收时果实的成熟度，并在采前控制氮肥的施用，适量施用磷钾肥，多施用氮肥不但会增加虎皮病的发生程度，而且会降低苹果品质，而施用磷钾肥则可改善果实品质，降低虎皮病发生率。另外还应合理修剪果树，使树冠透光，促进果实着色，提高果实品质，也会显著减轻病害发生程度；果实采收后应及时预冷，采用低温、气调贮藏（低氧气调），并结合1-MCP处理可以有效控制虎皮病的发生。
二、苹果苦痘病
苦痘病又名苦陷病，是一种缺钙引起的苹果生理病害。在果实近成熟期开始出现症状，贮藏期继续发展。病症表现为初期皮下果肉褐变，果面稍有凹陷，色较暗，之后果皮下局部组织干缩坏死，呈海绵状，表面形成大小不一的褐色陷斑。后期果皮内陷，呈灰褐色或绿褐色，红色果面处为暗红色圆形或不规则斑，病斑深约0.2～0.6厘米，严重时病斑布满果面，坏死组织有苦味，病果易染菌腐烂。果实萼端比其它部位易发病，同一品种大果比小果发病重，修剪过重，偏施、晚施氮肥，树体过旺及肥水不良的果园发病重。果实生长期降雨量大，浇水过多，易加重病害发生。
果实缺钙或钙与其它元素之间失衡是苹果苦痘病发生的主要原因。防治上主要是生长季树上喷施氨基酸钙、硝酸钙等，避免过量施用氮肥，注意平衡施肥，合理修剪，改善通风透光条件，合理负载，保持树体健壮。果实采收后用2～6%氯化钙、硝酸钙液喷洒或浸果，也有一定防治效果。
三、水心病
苹果水心病又称蜜病，俗称糖化。是在果实成熟后期，贮藏期间出现的一种生理性病害。症状是在果心附近的果肉部分呈水浸状，有透明感，味道变差，但果肉质地较硬，重病果的水渍状斑则可扩展到果面，可透过果皮表现出水浸状，贮藏后期，病变组织败坏变褐腐烂。发生水心病的果实山梨糖醇含量较高，果实组织山梨糖醇、钙、氮等代谢失调是水心病发生的一个重要因素。苹果水心病的发生与品种、果实成熟度、温度、栽培条件、贮藏条件等因素有关。我国栽培的富士、红露、新红星、北斗等品苹果品种发病较重，金冠、国光、金帅等品种发病较轻。水心病发生率随果实成熟度的增高，日照强气温高，气候干燥的地区水心病发病率高，在干旱半干旱气候地区，有较高的发病率。一般结果多，树势弱，树体郁闭，钙素营养不良，施肥修剪不当，套袋等，均能引起果实缺钙，从而导致水心病的发生。水心病的出现和变化随季节和地点而不同，在比较温暖和相对湿度较低的条件下水心病症状消失的速度更快，相当数量的水心病果在存贮中可能被减少。
水心病的发生是由多种因素引起的，要进行综合防治。防治方法应正确选择品种与地理位置，合理修剪，尤其做到适期采收。果园施肥应注意增施磷、钾肥，适当控施氮肥，特别是铵态氮肥。果树生长期喷施硝酸钙，入库前用硝酸钙或氯化钙浸果对水心病防治有一定效果。
四、二氧化碳伤害
在苹果气调贮藏或苹果在贮藏、运输过程中都可因CO2浓度过高而对苹果造成CO2伤害或CO2中毒。二氧化碳伤害有果实内部伤害和外部伤害两种情况。内部伤害果肉果心局部组织出现褐色小斑块，并逐渐扩大，最后出现空洞，最后病变部分果肉失水成干褐色空腔，食之有苦味，整果风味变淡，伴有轻微发酵味，病变也可能扩展到果皮，使呈褐斑，最后果皮全部变褐，并出现褶皱。外部伤害只伤害果皮，病变组织界限分明，先变黄褐色，然后深陷，果皮粗糙起皱。贮藏后期受伤组织变成褐色，甚至黑褐色。二氧化碳伤害的发生及部位与苹果品种、气体成分有关。
防止此类伤害的方法是在气调贮藏中对不同品种调节好适宜的气体成分，及时去除苹果呼吸产生的过量CO2，欧美国家一般把CO2调控到0.5～1%的水平。另外，贮藏、运输过程中要保证苹果适宜的通风条件，以免因局部CO2浓度过高而对苹果造成伤害。一般维持氧在2％～4％、二氧化碳在3％～5％的气调环境中，可避免二氧化碳伤害。
五、果肉褐变病
果肉褐变病症状为果肉呈淡褐色，果肉部分褐变或全部褐变或，褐变区域或仅局限于果肉部分或波及果心和果皮，症状复杂。多与果实采收偏晚、成熟过度，贮藏环境高CO2浓度、高温高湿有关。可以通过适时采收，控制好贮藏环境温湿度，2%～4%氯化钙液浸果等手段加以预防。
六、低温伤害
在冷库贮藏或一般贮藏中管理不当时，易发生苹果的低温伤害。低温伤害的发生与品种、低温程度和持续时间有关，短期低温并不一定引起组织伤害，伤害症状可以引起果皮至果肉不同程度褐变，伤害严重时，整果呈水渍状（半透明状），果面凹陷，果肉中有很大的空腔，组织细胞坏死。低温伤害的防治方法主要是掌握好贮藏温度和低温时间。有些苹果品种贮藏在0～1℃时，发生低温伤害，即果心周围变褐。对低温敏感的品种，防止此病的有效方法是提高贮温，贮在2～4℃为宜，或暂时加温处理，在贮藏初期缓慢降低温度，如从3.5℃经6～8周降至0℃，也有减轻低温褐变的效应，但也稍微缩短贮藏寿命。