不同产量水平苹果园的土壤微生物状况。高产果园土壤微生物数量高，土壤酶活性强，微生物多样性好，低产果园则相反。土壤微生物中细菌数量、微生物多样性可作为评价果园土壤肥力的生物指标。
不同质地土壤（河沙、壤土、粘土）的苹果园土壤微生物数量变化。土壤中可培养细菌、放线菌数量、革兰氏阳性菌均为壤土>粘土>河沙，而真菌、革兰氏阴性菌和AMF菌则是粘土>壤土>河沙。
施加有机肥根际细菌、真菌、放线菌数量增加，氮肥处理具有双重性，细菌在200 mgkg-1时数量最大，而真菌和放线菌则是在500 mg kg-1数量最高，高浓度氮肥抑制细菌、真菌、放线菌数量。3%的有机肥处理根际微生物数量大幅提高，6%有机肥处理微生物增加幅度不如3%有机肥。有机肥的施加促进了各类有益微生物数量的增加，施加不同类群、不同浓度的氮肥，有益微生物数量的变化不同。钾细菌、自生固氮菌与氮肥浓度成反比，均低于相应的对照；有机磷细菌数量＞无机磷细菌，二者的变化基本相同，有机磷和无机磷细菌在200 mg kg-1处理时数量增加，高浓度氮肥处理时也受抑制；芽孢杆菌对氮肥的耐受力较高，在500 mg kg-1处理数量仍较大，体现了芽孢对不良环境的抗性作用。
不同种植年限的果园土壤微生物变化。壮龄果园的土壤微生物活性最高，是幼龄果园的1.23倍，老龄果园的1.37倍；微生物的生物量幼龄和壮龄果园间差异不显著，但远大于老龄果园，约为老龄果园的3倍；随着树龄增大，细菌/真菌的比例下降，放线菌的含量也随树龄增大而降低；土壤微生物的多样性随树龄增大先增高后降低，以壮龄果园的微生物多样性为最好。
施用海藻生物有机肥对果园土壤微生物的影响。施用海藻生物有机肥可显著增加土壤中可培养细菌及放线菌的数量，细菌数量为对照土壤的2.81-9.30倍，放线菌数量为对照土壤的1.95-18.62倍。施用海带肥及浒苔肥均可显著提高微生物生物量，微生物总量为对照土壤的1.60-2.64倍。施用海带肥和浒苔肥可增加土壤微生物中单不饱和脂肪酸的含量比例。海带肥及22.5kg/株浒苔肥处理对土壤微生物种群结构的改变较大，而7.5kg/株和15kg/株浒苔肥对微生物种群结构的影响较小。
同时，土壤生物如蚯蚓也对果园土壤有显著影响。在有机质较高根际环境较好条件下，每平方米达8条蚯蚓可以线虫危害。