苹果生产栽培苗木，一般是由砧木与品种接穗两大部分组成。接穗是嫁接在砧木上的品种枝或芽，砧木是接穗嫁接部位以下部分。中间砧苗木基砧和中间砧两部分组成，基砧是基部直接嫁接品种或中间砧的带有根系的砧木故又称根砧，包括实生砧木和营养系砧木。苹果乔砧苗木繁育过程是，把海棠或山定子种子下地，长到一定的粗度后，再嫁接上品种，而成为生产用乔砧苗木。这种用种子繁育的砧木，称为实生砧木，也称为有性砧木即实生根系砧木。如果砧木是通过扦插、压条、组培等营养繁殖方法获得的砧木，称为营养系砧木，也称无性系砧木即茎源根系砧木。乔砧苹果苗就是乔化砧木嫁接苹果品种后培育而成的苹果苗。
苹果矮化砧是嫁接上品种有矮化作用的砧木。由于矮化砧利用方式不同而苗木分为：矮化自根砧苹果苗即在营养系矮化砧木上嫁接苹果品种后培育而成的苹果苗；矮化中间砧苹果苗在基砧上嫁接上一段矮化砧，再在其上嫁接苹果品种后培育而成的苹果苗。这种苗木有基砧为实生与营养系两个类型，中间砧就是位于接穗和基砧之间的砧段。
因此，苗木可分为以下类型：
1 实生根系乔砧苗木
在用种子播种后长出的乔砧苗上直接嫁接栽培品种接穗繁育而成的苗木。
2 茎源根系乔砧苗木
在用扦插或压条等营养繁殖出乔砧苗上直接嫁接栽培品种接穗繁育而成的苗木。也可称营养系乔化苗木，或自根砧乔化苗木。
3 茎源根系矮砧苗木
在用扦插或压条等营养繁殖出矮砧苗上直接嫁接栽培品种接穗繁育而成的苗木。也可称营养系矮化苗木，或自根砧矮化苗木。
4 实生根系矮化中间砧苗木
即基砧为实生根系矮化中间砧苗木。在用种子播种后长出的基砧苗上嫁接矮化砧木接穗，再在矮化砧木上嫁接栽培品种接穗繁育而成的苗木。
5 茎源根系矮化中间砧苗木
即基砧为茎源根系矮化中间砧苗木。在用扦插或压条等营养繁殖出基砧苗上嫁接矮化砧木接穗，再在矮化砧木上嫁接栽培品种接穗繁育而成的苗木。茎源根系矮化中间砧苗木，也可称为营养系矮化中间砧苗木。
目前，我国在苹果普通苗木和中间砧的育苗繁育上，基砧都是用种子进行繁殖育苗的，由于实生苗性状分离现象十分严重，导致树体大小不一，园貌不整齐。而用营养繁殖出来的就相对地一致。因此，在苗木繁育上，应选择适应性好，抗逆性强，丰产性高，用营养繁殖的方法进行繁育的砧木，以茎源根系代替实生根系，使苹果苗木基砧由种子（有性）繁育变为营养（无性）繁育。由于根、茎均进行营养繁殖，除了生长整齐度好外，还具有更好的矮化效果。缘砧木繁殖材料生理年龄大，成熟度好，繁更容易繁育出健壮的成花的大苗，实现早实丰产。目前在苹果生产上，树龄更新年限比以前明显变短，约15-20年左右，建立苹果乔砧及矮砧营养系苗木繁育体系意义重大。