1 建立完善的苹果脱毒种质资源圃
无病毒母本园包括无病毒苹果品种采穗圃、无病毒砧木采种园、无病毒无性系砧木压条圃和矮化砧木采穗圃。繁殖圃所用种子、无性系砧木繁殖材料和接穗，都必须来自无病毒母本园，不允许从苗木上或生产园中采接穗繁育苗木。
利用脱毒、矮化砧、大苗建园已是世界上普遍采用而取得巨大成功生产模式。
二十世纪70年代以来，世界果树生产发生了一个显著的变革，就是大力推行和普及无病毒栽培，并已取得了巨大的经济和社会效益。据介绍，用普通苗木建园有的苹果病毒病害带毒株率均在85%以上，导致树势衰弱，果品产量和质量下降，难以用药剂进行有效防治，终生受害。防治苹果病毒病害的根本途径就是采用脱毒苗木栽建园。
苹果无病毒即脱毒苗木繁育过程是：无病毒原种保存圃（通过组培等一系列脱毒处理及保存）→无病毒母本园（从无病毒原种保存圃引回的繁殖材料）→无病毒苗木繁殖圃（所有繁殖材料和品种接穗都严格按操作规程来源于无病毒母本园）。
无病毒母本园采穗圃栽植前做好土壤改良，加强肥水管理，可采用株距0.5米，行距2.0米左右。边采接穗边培养，株行距逐步调整1.0×2.0米。采用细纺缍形结果，冠高控制在2.0米左右。调查表明：采穗圃必须通风透光，才能生产出芽体饱满的接穗。
苹果是多年生的果树只有实现良种良砧良法综合配套，才能取得良好的经济效益。近几年随着我国苹果栽培制度的改革，已经把“无毒、矮化、壮苗”作为育苗方向，为了满足生产需求，必须立足于我国实际情况，建立各种苗木类型的育苗繁育体系，实现优质苗木的规模化生产。从基砧根系类型可分以下两个体系。
2 实生根系的苗木繁育
即基砧根系通过利用种子播种繁育而来。可繁育实生根系乔砧苹果苗与中间砧矮化苹果矮化苗。
（1）实生砧木繁育
A、种子处理
选择种子充分成熟，纯度和净度均在95%以上，发芽率不低于80%。于12月底，于背阴、高燥处挖深40 cm左右的坑，将种子用温水浸泡24小时后，用200-300倍多菌灵溶液浸泡半小时，与干净的湿沙调匀（砧木种子和湿沙的比例为1：3～1：5，层积沙的适宜含水量在40%～55%，湿度以手握成团，松手即散为好），用袋子装好放到低温处冻实后，放到挖好的坑内。定期检查，使保持正常湿度。层积温度以0℃～5℃为宜。
B、播种扣棚
按90 cm宽做畦，每畦按2-3行进行条播，播种2-2.5 Kg/666.7 m2，播种深度以2 cm左右为宜。覆土后喷上除草剂，扣小拱棚。随气温升高，在拱棚上打孔通气降温，待气温稳定后再去掉棚膜。
C、移栽
在幼苗长出2-3片真叶时进行间苗移栽。移苗前2-3天对苗圃进行轻浇一次水，以便移栽时根部带土。移苗时应选择阴天或傍晚进行。在幼苗长到4-5片真叶时按15-20 cm的株距进行定苗。间苗、移栽后及时浇水。
（2）接穗的采集与保存
接穗从采穗圃采集。选择圃内生长充实、节间相对较短、芽体饱满的一年生枝为接穗。春季嫁接用的接穗要在苹果落叶后封冻前采集放于保鲜库或挖沟进行湿沙贮藏。夏秋季嫁接最好使用上年保鲜库保存的硬枝进行嫁接，也可采集芽体饱满的当年生发育枝。
（3）嫁接
A、嫁接时间
春季、夏季、秋季砧穗形成层活动期均可进行嫁接。从生产大苗的角度一般要求春接或秋接，从生产调查上来看还是以春接为最好。
春季嫁接的时间一般在3月中下旬至4月上旬芽子萌动之前进行。
夏季嫁接一般在6月下旬至7月初，嫁接时间宜早不宜晚，越早越好。
秋季嫁接一般在8月中下旬-9月上旬。宜早不宜晚，越早则成活率高。
B、嫁接方法
春季嫁接切腹枝接，即用切腹的2-3芽的枝接。方法简单，用磨快的剪树剪，在砧木的上部剪一斜口，同时，把接穗削成两个斜面插入，保留好芽并剪下多余的接穗后用塑料薄膜对接穗及砧木进行包扎(以0.04 mm为最好，对芽体进行单层包扎，这样芽可以自动萌出)。春季嫁接的接穗必须用清水浸泡12-24小时再嫁接。
夏秋嫁接均为生长季节嫁接，多采用嵌芽接。夏秋季嫁接凡是用硬枝嫁接时，均需清泡12-24小时以上再进行嫁接，如绿枝嫁接，随采随接。生长季采集的接穗立即剪去叶片，仅留一段叶柄，捆好后置于水盆（槽）中，接穗底部没于水中5 cm左右为宜，放置于室内或遮荫处，随接随取。
夏季芽接的苗木在接后10-15天剪砧，秋季嫁接的芽接苗翌春发芽前剪砧，剪口距芽片0.3-0.5 cm。解绑、剪砧以后，及时抹除砧木上发出的萌芽。
3 茎源根系砧木苗木繁育体系
基砧根系可通过压条、扦插、组培等营养繁殖方法获得，即营养系砧木根系、无性系砧木根系。
（1）营养系矮砧苗的繁育
分两种方式：
A、压条法。选择优良的矮化砧木，按行距1 m、株距30-50 cm定植，沿着行的方向使植株与地面呈30°栽植。成活后顺行向将枝条压入5-8 cm深10-20 cm宽的浅沟内，用枝杈固定。待新梢长至15-20 cm左右时第一次培土，深度约10 cm左右，随着新梢的继续生长，可进行第二次、第三次培土，使培土高度达到30 cm左右，宽度达到40 cm左右。培土时，将埋入土中部分的叶片全部摘除。秋天落叶后分株贮藏。（小规模育苗可使用这种方法，但这种方法不适合于大规模育苗。其优点不如埋土法。）
B、埋土法。按行距120 cm，株距20 cm栽植砧木苗定干，当新梢长到15-20 cm开始培土，随长随培，最后畦高40 cm。每年落叶后封冻前剃平分株，剃到一年生基部处。这种方法第一年3-5条，以后6-7条。要比压条法繁殖系数高。这种方法也便于机械化作业。应选择透气性好沙壤土，建立矮化砧繁育圃。
（2）砧木与接穗的贮藏
将砧木苗与接穗均须封冻前放到保鲜库或沙藏。保鲜库苗木贮存温度与湿度：0.5-1℃。湿度96%；进行沙藏时，选择一个便于看护、背阴不存水的地方挖贮存沟，并使该贮存沟的的温度与湿度保持稳定，该温度为0-5℃，沙的湿度以手握成团而不滴水为宜。
（3）嫁接与栽植
春节后进入3月份可以先室内嫁接（嫁接法同上），按照要求砧木的高度，嫁接品种。砧木与接穗需先用清水浸泡12-24小时后再进行具体嫁接。这是非常重要的一个环节，其主要作用是，补充其贮存期间的失水，改善调节其生理机能，满足生根愈合对水分的需要。可用切腹枝接后，对枝接部位用塑料薄膜进行包扎。
分株嫁接后进行田间栽植，培养有花芽分枝的大苗。
A、砧木。使用易成花的砧木如M9T337等，对于长势旺成花难的品种如富士系要在基砧上嫁接一段中间砧木，再嫁接品种，以确保成花。
B、密度。可按80-100×20-30 cm栽植，行距大能够通风透光，增强光合作用，同时便于作业。株距小，便于培养标准直立的标准树形。为了使苗木直立生长，苗木要用竹杆等采用株株支架办法支撑。
C、促枝。利用能够促进分枝的生长调节剂，进行定位定向定质地促生发枝。要求对60厘米以上枝段芽芽发枝。
D、促花。在苗圃里完成营养生产向生殖生长的转化，促枝成花。当苗木长到一定高度时，要控制其生长。完成营养生长到生殖生长转化的客观形态就是：新梢生长减缓或基本停长。凡是能够使新梢生长减缓或基本停长的措施都是有利于成花的措施，如摘嫩叶，喷打生长调节剂如PBO、B9等。（说明：我在生产调查中发现：在一年生的苹果苗木中，特别高的苗木，尤其是一米七以上的苗木，苗非常地高，而根却非常地小，地上与地下生长非常地不对称、不协调；而一米五左右的苗木，虽然苗木高度不太好，但根系却非常地大。很显然是后一种苗木生理更成熟，更容易成花）。
E、土肥水管理。细胞激动素的增多及细胞液浓度的增加，这是花芽分化的重要内部条件。这就涉及到土肥水管理：确保表层根不受伤害（地面覆盖、保持地面湿润、忌用除草剂等），及时追施肥分全的肥料，同时要浇小水，忌浇大水。适度干旱，促进花芽分化。
凡是难以生根的砧木如M26、M9及M9T337等均用以上两种方式进行自根砧苗木繁育。
4 营养系砧木苗木的扦插繁育
对于适合于扦插繁育的砧木如日本圆叶海棠等采取先室内嫁接再田间扦插方法进行。利用：扦插在适宜的条件下，愈伤组织与不定根相继发生或同时发生。愈伤组织与不定根需要的温度、湿度及其他条件是一致的。扦插与嫁接都是愈伤组织的问题，二者需要同样的内因条件与外因条件，既让它生根又让它愈合，作为扦插与嫁接同时进行的理论根据。扦插与嫁接同时进行，一次性完成。从而建立新的苹果苗木繁育体系：
一是，改单芽接为枝接。改单芽接为枝接，枝接长势要明显地好于单芽接长势。
二是，改田间嫁接为室内嫁接。室内嫁接和田间扦插同步进行，好处是：缩短一半育苗时间，由两年变为一年；降低生产成本。室内嫁接比田间要省工，同时可在冬季农闲季节进行；实现工厂化批量规模化育苗。
三是，加速矮化砧苗木的繁育速度。弥补自根砧的矮化苗木的繁育速度过慢，生产成本大、不能迅速形成规模化生产的缺点。建立新的矮砧苗木繁育体系。
四是，改基砧种子繁殖为营养繁殖。基砧由种子繁殖改为营养繁殖，使苹果苗木砧木由种子（有性）繁育变为营养（无性）繁育，即在苗木繁育上全部为营养繁育，从而保证生产栽培上树体大小相对一致，由于育苗时间缩短，加大了我国在苹果普通苗木和中间砧的营养根系苗木的应用速度。
五是，改“小苗”生产为“大苗”生产。建立繁育高质量的“大苗”的生产机制。由于根、茎均进行营养繁殖，繁殖材料生理年龄大，成熟度好，除了生长整齐度好外，还具有更好的矮化效果。也更容易繁育出健壮成花的大苗，实现早实丰产。
（1）扦插自根砧苗木繁育
A、砧木与接穗的选取：砧木与接穗均需落叶后封冻前从采穗圃采下进行贮存，避免发生冻害。如砧木适宜于扦插如日本圆叶海棠等，当落叶后，选择粗壮的枝条，按生产要求15-17 cm进行剪截，（加上嫁接时损耗），进行打捆，每捆20根，不要打乱极性，且每根枝条的芽体的朝向相同，下端可剪成楔形，进行贮藏；所用接穗为目前生产栽培的苹果品种与砧木，如矮化砧木M9、M26等。
B、砧木与接穗贮藏：沙藏或放入保鲜库贮存，对于砧木来说，贮藏的过程就是自然催根的过程。贮藏是生根的必要条件之一，进行沙藏或保鲜库贮存就是进行自然催根。将砧木进行沙藏时，选择一个便于看护、背阴不存水的地方挖贮存沟，并使该贮存沟的的温度与湿度保持稳定，该温度为0-7℃，沙的湿度以手握成团而不滴水为宜，在贮存沟的底部放10-20 cm细河沙，砧木放好后再放上一层5-10 cm细河沙，其上再盖上湿土，砧木单层或双层、极性相同且生根面朝上放置，这是因为3月份以后的温度上面要高于下面，贮藏的过程就是自然催根的过程。
接穗的贮存采用保鲜库贮存，保鲜库温度为0.5-1℃，湿度为0.96 RH。
如果冬前没有剪截成段，在嫁接前一个月也必须进行剪截，进行沟臧催根处理。如3月中下旬进行嫁接，2月中下旬必须进行完剪截处理。
C、嫁接前的处理：砧木与接穗需先用清水浸泡12-24小时后再进行具体嫁接。这是非常重要的一个环节，其主要作用是，补充其贮存期间的失水，改善调节其生理机能，满足生根愈合对水分的需要。
D、进行枝接：用切腹枝接后，对枝接部位用塑料薄膜（0.04 mm）进行包扎。因为嫁接后、愈合前的所需要的水分和养分都是由各自的贮藏来供给。这种方法的主要优点是：一是，改嵌芽的单芽接，为切腹的2-3芽的枝接。生产实际证明：用枝接要比接的长势好。接穗即品种部分越大，长势就能相对越好。具备扦插长势好的物质条件。二是，方法简单，用磨快的剪树剪，在砧木的上部剪一斜口，同时，把接穗削成两个斜面插入，保留好芽并剪下多余的接穗后用塑料薄膜对接穗及砧木进行包扎。三是效果好。由于是2-3芽的枝接比单芽的体积大，有满足生长发育的营养条件，同时，接前砧穗又充分的吸足了水分，而又用塑料薄膜进行地上部分的包扎，创造了保持水分的良好的环境条件，大大地满足了其生根愈合的内因条件与外因条件。成活率高，长势好。
E、大田扦插：具体为每年的3月中下旬进行扦插，要求将地整平、整细，灌水后覆黑地膜。覆黑地膜主要作用提温与保湿。但关键点是：要使生根先于发芽。覆膜可以增加地温，确保根部温度高于接穗的温度；同时，具有良好的保湿作用，这样一来，地上地下创造其良好的生长发育的环境条件。
扦插前根部用1000 mg/kg的IBA液中浸泡2秒，用树条在地膜上捅一小口，插入枝接后的砧木和接穗，枝接部位露于地膜之上，行距30 cm、株距15 cm左右，扦插后使含水量保持在保持范围60-80％。扦插不宜过深，深度为7-12 cm，嫁接口距地面10-15厘米左右，但群体扦插深度要一致，一般个体间±1 cm内，并在枝接的部位下，扶起小垄或于一周左右再扣上小弓棚。也可不覆黑地膜，直接扣小弓棚。
（2）利用扦插矮化苗木的繁育
矮砧密植栽培是当前世界苹果生产上主要栽培模式，也是我国苹果栽培发展的必然方向和趋势。随着我国苹果生产向矮化砧栽培模式的大变革和老龄苹果果园的大规模更新换代，加强苹果矮化砧的应用研究及其开发利用具有特别重要的意义。
目前，我国苹果矮化苗木有矮化中间砧苗木与矮化自根砧苗木。矮化中间砧苗木是在基砧上嫁接矮化砧木接穗，再在矮化砧木上嫁接栽培品种。矮化自根砧苗木就是在矮化砧木嫁接栽培品种。利用本苗木繁育法也可进行这两种苗木的繁育。
A、矮化中间砧苗木繁育
目前，苹果中间砧苗木的基砧有两种一为种子实生根系；一为营养系即茎源根系。从生产发展趋势来看，后者更为有前途，因为营养繁殖个体之间差异相对一致，早果性好。常规的生产程序为：当基砧种子播种（实生根系）或枝条扦插（茎源根系）后，长到一定高度和粗度后，再嫁接上矮化砧木，等矮化砧木长到一定的高度与粗度后，再在其上嫁接栽培品种。两次嫁接均要田间完成。如此一来，繁育出成苗约需三年左右的时间。但用此繁育法培养苹果中间砧矮化苗木，将大大地减少育苗时间与生产成本。
在适宜于扦插如日本圆叶海棠的砧木上，嫁接上矮化砧接穗后扦插。等矮化砧长到一定高度再嫁接栽培品种。这种生产程序要比日本圆叶海棠扦插长大后嫁接矮化砧接穗，等矮化砧长到一定高度再嫁接栽培品种的生产程序要快得多，要节约一年的时间。砧木与接穗采集与保存、嫁接与扦插等与上相同，唯一不同之处在于圆叶海棠剪截长度要相应地变短，一般长度10-12厘米左右。
B、矮化自根砧矮化苗木繁育
目前，自根砧矮化苗木繁育的最大难点是，繁育非常地困难，影响了矮砧密植栽培的发展。在生产上多采用压条与培土生根两种方法，等砧木生根长到一定的高度时，再嫁接上栽培品种。由于常规压条与培土的方式使矮化砧生根，再嫁接上品种，比较麻烦，生产成本高，也不利到大批量规模繁育。我们可以用苹果矮化中间砧苗木繁育的两种方式进行矮化自根砧矮化苗木繁育。不同点在于：
一是，基砧的长度可适当短一些，10 cm左右即可（基砧只起引发矮化砧生根的作用）。
二是，开小沟扦插或扦插的深度稍深，生长季节土要埋到矮化砧的二分之一处。
三是，等矮化砧生根后，把下面的基砧去掉（用锨铲除或移栽剪掉。实际上只要嫁接部位不解绑，基砧就会变得很小），就能培养成货真价实的矮化自根砧苗木。
在这种方式中，扦插砧木如圆叶海棠只是起“过渡”作用，用这种迂回的方式即“媒介根”培育自根矮化苗木，可以有效的降低生产成本，也可以实现规模批量生产，从而满足生产上对各种类型苗木的需求。
在生产中，这种方法与培土法等相结合，可以充分地把矮化资源利用起来。即把用培土法等常规产生的矮化砧木苗木，分株嫁接部位以上枝段，可再用这种方法进行进行矮化苗木繁育，充分利用矮化资源。而这些嫁接均可在室内完成（年后就可进行，农闲嫁接易调节劳动力，降低生产成本）。