苹果花叶病主要表现在叶片上，由于苹果品种的不同和病毒株系间的差异，其部分患病症状与缺素症相似。 苹果花叶病主要有5种类型，其症状区别如下：
斑驳型：病叶上出现大小不等，开头不定，边缘清晰的鲜黄色的病斑，后期病斑处常易枯死。在年生长周期中，这种病出现最早，而且是花叶病中常见的一种症状。
花叶型：病中上出现较大块的深绿与浅绿的色变斑，边缘清晰，发生略迟，数量不多。
条斑型：病叶上会沿中脉失绿黄化，并延及附近的叶肉组织。有时也沿主脉及支脉发生黄化，变色部分较宽；有时主脉、支脉、小脉都会呈现较窄的黄化，能使整叶呈网纹状。
环斑型：病叶上会产生鲜黄色的环状或近似环状的病纹斑，环内仍成绿色。发生一般少而发生晚。
镶边型：病叶边缘的锯齿及其附近发生黄化，从而在叶边缘形成一条变色镶边，近似缺钾症状，病中的其它部分表现正常。这种病症仅在金冠、青香蕉等少数品种上可以偶尔见到。
在自然条件下，病症可以在同一株、同一枝甚至同一叶片上同时出现，但有时也能出现一种类型。在病重的树上叶片易变色、环死、扭曲、皱缩，有时还可导致早期落叶。花叶病斑上易发生圆斑病；病株新梢节数减少，因而造成新梢短缩；病树果实不耐贮藏，而易感染苹果炭疽病。