病原菌以菌丝体、分生孢子器及子囊壳在被害枝干上越冬，菌丝在枝干病组织中可存活4-5年，春季通过菌丝体直接侵染或通过雨后产生的分生孢子侵染树干，枝干上的病菌为该病电的主要传染源。果实从幼果期至成熟期均可被侵染，但是以幼果期为主，采果前为发病盛期。
苹果轮纹病的发生和流行与气候、树势和品种等关系密切。高温多雨或降雨早且频繁的年份发病重；管理粗放、挂果过多以及施肥不当，尤其是偏施氮肥的果园发病重；植株衰弱的植株、老弱枝干及老病园内补植的小树均易染病。
发病条件：苹果轮纹病的发病首先与果园的郁闭度有关系，光照条件好、通风透光、温度和相对湿度较高，一般温度在20℃以上，湿度达到75%以上就容易发生。特别是降水量较大，达到10毫米以上时，果园中大量的细菌开始繁殖、迅速扩散，并侵入到果实和树体中。在种植多年的老果园中，由于较长时间的病菌积累导致细菌极易扩散，所以传染力较大也较快。在园区日常管理中较为粗放，土壤黏重、树势较弱、土壤肥力不够的植株也易发生病害，受到病害侵蚀。
发病原理：苹果轮纹病的发生主要是因为菌丝体和分生孢子器在冬季之前开始在枝干中隐藏，特别是在枝干的病部，等到春季气温上升后，分生孢子器开始不断繁殖，从枝干的受损处传播，逐渐侵入树体的各个部位。到7-8月份，温度升高、湿度加大，病菌发展成熟在果实的成熟期和贮存期发生。同时该病的发病率与苹果的品种也有极大的关系，如富士、千秋、王林等品种属于高发品种。